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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  27 lines
  1. *********************************************
  2. * Eukaryotic initiation factor 4E signature *
  3. *********************************************
  4.  
  5. Eukaryotic translation initiation factor 4E (eIF-4E)  [1]  is  a  protein that
  6. binds to the cap structure of eukaryotic cellular mRNAs. eIF-4E recognizes and
  7. binds the 7-methylguanosine-containing (m7Gppp)  cap  during  an early step in
  8. the initiation of protein synthesis and facilitates ribosome binding to a mRNA
  9. by inducing the unwinding of its secondary structures.
  10.  
  11. eIF4-E is  a  conserved protein  of  about 25 Kd.  Site  directed  mutagenesis
  12. experiments  have  shown [2]  that  a  tryptophan  in  the central part of the
  13. sequence of human eIF-4E seems to be implicated in cap-binding.  The signature
  14. pattern for eIF-4E includes this tryptophan.
  15.  
  16. -Consensus pattern: F-[KR]-[DN]-x-[LIVM]-x-P-x-W-E-D-x(5)-G-G-[KR]-W
  17.                     [The first W seems to be involved in cap-binding]
  18. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  19. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  20. -Last update: October 1993 / First entry.
  21.  
  22. [ 1] Thach R.E.
  23.      Cell 68:177-180(1992).
  24. [ 2] Ueda H., Iyo H., Doi M., Inoue M., Ishida T., Morioka H., Tanaka T.,
  25.      Nishikawa S., Uesugi S.
  26.      FEBS Lett. 280:207-210(1991).
  27.